工具:电脑。步骤如下:1.确定脚本bp_genbank2gff3.pl所在的目录,比如这个脚本在/home/username/Download/目录下;2.使用perl执行该脚本,并添加参数,参数就是源文件名;比如源文件放在了/home/username/Document/目录下,文件名是GCA_genomic。
如何将基因序列上传到Genebank,从而获得序列号? 希望虫友能给出详细的。有两中方法可以提交你的序列:1、进入NCBI网站,左侧有sequence submissions ,点击进入Submit to GenBank利用BankIt在线投递,特点是比较方便,你按照程序的说明一步步跟着操作就可以了,满简单的。2、从NCBI的ftp上下载提交序列的软件sequin,。
genbank数据库默认输出序列格式步骤如下。进入NCBI,在AllDatabases下输入所要查的基因名称,例如NADPH,点search,会跳出很多信息,点击Nucleotide进入后会有很多关于序列的信息,根据你的具体情况进行选择。当然,如果你知道该序列的Genebank,那就更简单了,直接在首页sear。
genebank号和Entrez Gene号有什么区别Entrez Gene比genebank更加全面和先进。 GenBank: GenBank是美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information ,NCBI)建立的DNA序列数据库,从公共资源中获取序列数据,主要是科研人员直接提供或来源于大规模基因组测。
如何向genebank申请提交新序列一般有两种方法, 一是:BANKIT 二是用sequin。 到NCBI上找一下就可以了。
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